科学家杰克在一次实验中意外获得隐身能力，却因无法控制而沦为犯罪的透明人。与此同时，昆虫学家汤姆在遭遇基因突变后，获得了苍蝇的超感知与飞行能力，成为蝇男。当透明人利用隐身盗取国家机密时，蝇男凭借敏锐的嗅觉和复眼视觉追踪其踪迹。一场城市暗处的对决展开，透明人试图隐藏行踪，而蝇男则利用声波定位和唾液腺分泌物制造陷阱。最终，蝇男在废弃工厂设局，用紫外线灯迫使透明人显形，两人激战至天明。透明人体力耗尽，被警方抓获，而蝇男选择隐退，继续维护城市和平。
